Artikel Terkait
Majalah Farmasetika – Tampaknya setiap beberapa minggu kita mendengar tentang varian COVID baru, dan sulit untuk mengetahui seberapa khawatir kita seharusnya.
Sebuah varian “rekombinan” telah muncul, dijuluki “Omicron XE”, yang merupakan hasil dari dua strain omicron bergabung bersama dalam satu host dan kemudian menginfeksi orang lain.
Jadi apa yang kita ketahui tentang hibrida baru ini, dan apakah kita perlu khawatir?
Mengenal Omicron dan variannya
Omicron adalah varian dari virus SARS-CoV-2 yang pertama kali ditemukan di Botswana pada 11 November 2021 dan ditetapkan sebagai varian yang menjadi perhatian oleh WHO pada 26 November. Sejak saat itu, virus tersebut telah ditransmisikan ke seluruh dunia dan menggantikan Delta menjadi varian dominan.
Sejak saat itu Omicron terus berevolusi untuk memiliki banyak garis keturunan yang berbeda, atau subvarian yang terkait secara genetik. Ini termasuk Omicron BA.1 (B.1.1.529) asli dan juga BA.2 dan BA.3.
BA.2 lebih menular daripada BA.1 dan sekarang telah mengambil alih atau mengungguli BA.1 untuk menjadi bentuk dominan baru dari virus SARS-CoV-2 di seluruh dunia, dengan WHO secara resmi mengumumkan hal ini pada 22 Maret 2022 .
Perbedaan yang kita lihat dengan Omicron relatif terhadap varian sebelumnya dijelaskan oleh jumlah mutasi yang relatif besar yang diperolehnya, dengan 60 mutasi tidak ditemukan pada virus asli yang berasal dari Wuhan, Cina.
Di antara mutasi ini adalah 32 perubahan genetik pada protein spike/lonjakan. Protein lonjakan adalah bagian dari virus yang digunakannya untuk menempel pada sel manusia, serta target respons imun terhadap virus, baik dari vaksin maupun infeksi sebelumnya.
BA.2 memiliki banyak mutasi yang sama dengan varian Omicron asli, tetapi juga memiliki 28 perubahan genetik uniknya sendiri. Empat dari perubahan genetik ini terdapat pada protein lonjakan, yang menjelaskan mengapa beberapa karakteristiknya berbeda dengan varian Omicron asli (BA.1), termasuk fakta bahwa protein tersebut tampaknya 30 hingga 50% lebih menular daripada BA.1.
Apa itu ‘rekombinan’?
Sama seperti kita telah melihat varian baru muncul, diikuti oleh evolusi subvarian atau garis keturunan yang berbeda, virus SARS-CoV-2 juga terus berubah dengan cara lain. Belakangan ini kita telah melihat tidak hanya perubahan spontan dalam kode genetik yang menyebabkan perubahan yang dijelaskan di atas, tetapi juga apa yang disebut rekombinan.
Rekombinan adalah tempat virus terkait bertukar materi genetik untuk membuat keturunan dengan materi genetik dari kedua virus induk. Hal ini dapat muncul ketika virus dari dua jenis (atau varian atau subvarian) yang berbeda menginfeksi sel yang sama.
Materi genetik virus dapat bercampur dan dikemas bersama untuk membuat virus rekombinan baru, dengan sifat salah satu atau kedua virus induk. Oleh karena itu, sifat-sifat virus rekombinan bergantung pada bagian mana dari materi genetik dari virus induk yang membuatnya menjadi versi baru – sama seperti Anda mungkin memiliki hidung ibu dan lutut ayah Anda.
Ketika Delta dan Omicron bergabung kembali, keturunan yang dihasilkan disebut sebagai “Deltacron” (meskipun secara lebih resmi ini disebut sebagai XD dan XF). Jenis rekombinan ini pertama kali diidentifikasi di Prancis pada pertengahan Februari dan tampaknya memiliki urutan genetik yang sebagian besar sama dengan Delta, tetapi dengan aspek protein lonjakan dari Omicron BA.1.
Jadi apa itu XE dan di mana penyebarannya?
XE adalah rekombinasi dari BA.1 dan BA.2. Ada banyak rekombinan BA.1 dan BA.2 lainnya, termasuk XQ di Inggris, XG dari Denmark, XJ dari Finlandia dan XK dari Belgia.
Sementara XE masih terdiri dari sebagian kecil dari total kasus yang diurutkan, itu telah menunjukkan bukti penularan komunitas, setidaknya di Inggris tempat pertama kali terdeteksi pada pertengahan Januari. Sekarang hanya ada lebih dari 1.100 kasus yang tercatat.
Itu juga telah diidentifikasi di India, Cina dan Thailand. Awalnya tingkat pertumbuhan untuk XE tampaknya tidak berbeda secara signifikan dari BA.2, tetapi data yang lebih baru dari Inggris menunjukkan bahwa ia memiliki tingkat pertumbuhan sekitar 10 hingga 20% di atas BA.2.
Data ini masih awal dan berdasarkan jumlah kecil, sehingga dapat berubah saat kami mendapatkan lebih banyak informasi. Jika benar, maka ini berarti XE cenderung sedikit lebih menular daripada BA.2, yang sedikit lebih menular daripada BA.1, yang lebih menular daripada Delta.
Apakah kita perlu khawatir?
Respons kekebalan kita yang membantu melindungi dari COVID-19 dihasilkan oleh vaksinasi atau dari infeksi sebelumnya, dan sebagian besar menargetkan protein lonjakan. Mengingat XE pada dasarnya memiliki protein lonjakan yang sama dengan BA.2, tampaknya perlindungan kami terhadap XE tidak akan berkurang secara signifikan.
Meskipun ini adalah sesuatu yang harus dipantau oleh lembaga kesehatan masyarakat dan kelompok ahli, dan memang demikian, ini bukanlah sesuatu yang tidak terduga mengingat jumlah kasus yang terus kita lihat di seluruh dunia. Sehingga hal itu tidak perlu menjadi perhatian ekstra bagi masyarakat umum.
Cara terbaik untuk memperlambat munculnya varian baru, serta rekombinan, tetap memiliki banyak orang di dunia yang dilindungi oleh vaksinasi untuk mengurangi kumpulan inang yang rentan di mana peristiwa ini dapat terjadi.
Sumber
What’s the new Omicron XE variant and should I be worried? https://theconversation.com/whats-the-new-omicron-xe-variant-and-should-i-be-worried-180584
